无论是肿瘤的病因还是治疗思路与方法，中医学与基因组学有着惊人的相似之处。中医把肿瘤的病因归纳为内因、外因和不内外因，认为环境中的“六淫”之气和机体正气虚弱再加上饮食、劳伤，是肿瘤的主要病因。基因组学认为肿瘤是多基因疾病，但外界因素，包括环境中的物理、化学、生物因素和不良生活习惯可以启动、激活原癌基因而引发细胞无序增殖，以致发生肿瘤，如黄曲霉毒素B1对某些基因在(如Cyp2D6基因)活化者更容易发生肝癌，环境中的苯并芘可使p53基因突变(G--T)造成肿瘤。
在治疗上中医旨在全身调整和辨证论治，中医治癌重视整体，甚至利用天时、地理等因素来调整平衡机体阴阳气血。重视个体，甚至顾及个体瞬间动态变化，强调“同病异治”和“异病同治”。而基因组学认为环境因素可以预防肿瘤的发生、发展，如多食粗纤维食物和及时切除大肠息肉，可减少家族性遗传大肠癌的发生。治疗上强调个体化治疗。采取激活人体的Rb、p53等癌抑因和nm23、DCC等癌转移抑制基因的作用，强化这类抑癌基因的表达，以抑制癌症的发生、发展和转移;采用基因置换、反义RNA技术和特异性蛋白酶、反义肽的应用等技术抑制癌基因的表达;人为设计细胞凋亡机制，利用转基因技术或在肿瘤细胞中导入p53等癌抑制基因，诱发肿瘤细胞调亡;给骨髓造血干细胞导入耐药基因，提高其对化疗药物的耐受性，从而增大化疗药物剂量，提高疗效，……这与中医药“扶正祛邪”的思路及中药多靶点、多层次、多效性治病作用十分相似。
但由于目前基因置换或克隆器官移植等方法还有许多问题有待解决，故尚需遵循“扰后原则”。自1990年9月14日美国批准人类首例基因治疗获得成功，至1998年底，全球已提出373临床方案，但真正进人皿期临床的只有2个方案，这是因为对导入基因的表达调控系统尚有许多未知因素，如1999年9月美国18岁高中毕业生在接受基因治疗4天后，因发热、凝血而死亡。为了最大限度地保护病人，目前的基因治疗只能遵循“优后原则”，即当其他传统治疗方法无效或微效时，方可使用较为成熟的基因治疗方案，对癌症的基因治疗也是这样，前景很好，但尚未解决的疑点还不少。相反，中医药治疗癌症历史悠久，疗效为世人所瞩目，许多方法的机理不断被分子生物学所阐明。如许多中药具有诱导细胞分化的作用，如砷剂、复方青黛片透过诱导白血病细胞分化和促使其凋亡来缓解白血病;姜黄、川芎等有抗耐药作用，从而增加对阿霉素、长春新碱等抗癌药的敏感性;黄芪、灵芝等扶正中药具有生物反应调节剂(BRM)样作用，提高体内NK、I‘AK细胞活性，诱生IL-2、INF抑杀癌细胞。还有龙葵、白毛藤等中药有调节信息传递样作用，由此不难判别如何透露中医药和基因治癌的方案。
中医治癌具有明显的特色和优势，己成为癌症综合治疗中不可缺少的重要方法。但必须遵循上述原则，在治疗时应审时度势，正确处理好扶正与祛邪，全身与局部、内治与外治的关系;积极配合现代医学手术和放化疗;始终贯彻“治未病”的思想，在治疗原发灶的同时，设法保护好转移的靶器官，防止其复发、转移;结合现代分子生物学、基因组学、蛋白质组学的理论，探索中医药治癌机理。开创中医治癌的新理论、新思路、新方法，让中医药治癌的方法为世人所理解，使其走出国门，为提高癌症病人的生存质量和长期生存率服务。
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