1.口腔和咽部
口腔(咽、舌、软腭、唇黏膜)感染可为急性白血病和粒细胞减少癌症患者的首见症状，一般在接受细胞毒化疗后发生。感染的局部发生溃疡，有时出现假膜。这些可继发于各种细菌或念珠菌属、单纯疱疹病毒、巨大细胞病毒或水痘型带状疱疹病毒感染。咽喉分泌物培养可出现多种病原体。而血培养阴性，很难确定主要病菌。患者有发热，主诉为疼痛，吞咽困难。有如不及时治疗会引起弥散性细菌感染。
2.皮肤和软组织
在注射皮肤处，穿刺部位(骨、腰、胸、腹)，妇、外科伤口处很易引起医源性感染，如肝癌术后的膈下脓疡。自发性皮肤感染也有，如腑下及腹股沟毛囊炎，可发展成大的脓疡随血传播。大多数致病菌为金黄色葡萄球菌，但革兰阴性杆菌也参与，特别在口和肛门周围出现蜂窝织炎。
3.肛门、直肠
肛门、直肠感染多见于白血病性粒细胞减少的患者。大部分感染出现为肛裂或炎性痔疮，扩散到会阴部呈蜂窝织炎，可发展成败血症。致病菌可见革兰阴性球菌和厌氧性革兰阴性杆菌。对中性粒细胞减少的癌症患者每天要进行肛检以发现病灶，进行预防性用药可以减少发病。
4.食管和结肠
由于化疗和胃酸反流致病原侵入食管引起食管炎。临床表现为胸骨后疼痛，咽食困难。致病菌有革兰阴性杆菌、单纯疱疹病毒、念珠菌属等。肿瘤患者常发生结肠坏死性病变，多见于粒细胞减少并接受抗癌和抗微生物治疗几周后发生。
5.中枢神经系统
据报道中枢神经系统感染占入院癌症患者的0.2%，表现为脑膜炎性占2/3。最常见于淋巴瘤、神经系统肿瘤、中性粒细胞减少及脾切除后，可由革兰阴性杆菌或真菌引起。患者有高热、头痛、精神变化和神智改变，应立即进行腰穿作脑脊液涂片和培养。但必须注意免疫受抑制患者很少出现脑脊液征象。患者可出现脓毒血症或菌血症。致病原有结核菌、新型链球菌、曲菌属、隐球菌、水痘带状疱疹和单纯疱疹病毒等。以上病原体也可产生脑炎样症状。在混合性感染可出现单个或多个脑脓疡。神经外科肿瘤患者术后可由于革兰阴性杆菌感染引起脑膜炎。
